Bulunan: 16 Adet 0.001 sn
Yazarlar ÖZER, Selmin
167536

Mersin ili Elvanlı Köyü’nde gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) yetiştiriciliği yapılan su kaynaklarında bakteriyel yükün araştırılması

ÖZER, Selmin

Mersin ili Elvanlı Köyü’nde iki dere üzerinde bulunan Gökkuşağı alabalığı işletmelerinin birbirilerine olan mikrobiyel etkilerinin belirlenmesi amacıyla 11.12.2007-20.01.2008 tarihlerinde, dere kaynaklarından, Dedekavak deresi üzerindeki bir işletme ve Karapınar deresi üzerindeki 3 işletmenin giriş ve çıkış suyundan toplam 78 adet örnek alınmıştır. Suyun sıcaklık, çözünmüş oksijen ve pH’ları ölçülmüş, 17ºC ve 35ºC’de toplam aerobik bakteri sayımı, fekal streptokokların sayımı, identifikasyonu ve antibakteriyel duyarlılık testleri yapılmıştır. Su örneklerinin toplam aerobik bakteri sayıları standartların üzerinde bulunmuştur. Örneklerin 20’sinde (% 25,64) saptanan fekal streptokokların 9’u (% 45) giriş suyu, 11’i (% 55) çıkış suyundan izole edilmiştir. Toplam 46 adet izolatın 20’si (% 43,48...

167538

Balıklardan insanlara bulaşan bakteriyel zoonozlar

ÖZER, Selmin

Zoonoz, “insanlarda hastalık oluşturan hayvansal hastalıklar” olarak tanımlanmaktadır. Günümüzde hem hayvanlarda hem de insanlarda enfeksiyonlara neden olan birçok zoonotik bakteriyel, viral, mikotik ve paraziter etken bilinmektedir. Günümüze kadar Gram-negatif mikroorganizmalardan Providencia rettgeri, Pseudomonas fluorescens, Escherichia coli, Hafnia alvei, Citrobacter freundii, Salmonella spp., Edwardsiella tarda, Serratia spp., Plesiomonas shigelloides, Motil Aeromonas’lar; Gram-pozitif mikroorganizmalardan Streptococcus iniae, Staphylcocccus epidermis, Clostridium botulinum, Erysipelothrix spp., Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium marinum, Mycobacterium chelonae ve Nocardia spp. balıklardan insanlara bulaşabilen zoonotik bakteriyel patojenler olarak bildirilmiştir. Bu derleme maka...

Derleme2004Ziraat Dünyası Dergisi 26 | 0 Erişime Açık
167488

Phenotypic and genetic homogeneity of Yersinia ruckeri strains isolated from farmed rainbow trout, Oncorhynchus mykiss (Walbaum), in Mersin Province, Turkey

ÖZER, Selmin | DÖNMEZ, Erdem | KOYUNCU, Erkin | SERİN, Mehmet Sami | ASLAN, Gönül | TEZCAN, Seda | AYDIN, Esin | EMEKDAŞ, Gürol

Twenty-four Yersinia ruckeri strains isolated from farmed rainbow trout, Oncorhynchus mykiss (Walbaum), in Mersin Province (Turkey) were investigated for phenotypic and genetic homogeneity by conventional microbiological techniques, the ID32GN system and arbitrarily primed polymerase chain reaction (AP-PCR). All isolates displayed phenotypic and genetic homogeneity by these techniques.

167528

Viral hemorajik septisemi virüsü ve infeksiyöz hematopoetik nekrozis virusunun moleküler epidemiyolojisi

ÖZER, Selmin

Molecular epidemiology of viral haemorrhagic septicaemia virus and infectious haematopoetic necrosis virus. Viral Haemorrhagic Septicaemia (VHS) and Infectious Haematopoetic Necrosis (IHN) are among viral diseases causing high fish mortality and thus economic losses in aquaculture. The main principles of amplification of G-and NV genes of VHSV and IHNV strains by RT-PCR, sequencing of these G-and NV gene cDNA including the intergenic region and the analysis of the relationship between viral strains are presented in this article Viral balık hastalıklarından Viral Hemorajik Septisemi (VHS) ve İnfeksiyöz Hematopoetik Nekrozis (IHN) balıklarda yüksek oranda ölümlere yol açarak önemli ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Bu derlemede, Viral Hemorajik Septisemi Virusu (VHSV) ve İnfeksiyöz Hemato...

167527

Kurbağa hastalıkları

ÖZER, Selmin

Kurbağa eti birçok dünya mutfağında yerini almış gıda değeri yüksek bir besin kaynağıdır. Evcil hayvan, eğitim ve araştırma aracı olarak da önemli olan kurbağaların tüm organ ve dokuları farklı sanayi kollarında değerlendirilmektedir. Günümüzde kurbağa ihtiyacı doğadan yakalandığı gibi daha çok yetiştiricilik yoluyla sağlanmaktadır. Yaban kurbağalarda son yıllarda meydana gelen kitlesel kurbağa ölümleri yanında, yetiştirilen kurbağalarda meydana gelen hastalıklar ekonomik kayıpların oluşmasında önemli bir yer tutmaktadır. Gerek yaban ve gerekse de yetiştiriciliği yapılan farklı kurbağa türlerinin birçok enfeksiyöz ve enfeksiyöz olmayan hastalıkları bulunmaktadır. Enfeksiyöz olmayan hastalıkları daha çok beslenme düzensizliklerine ve çevresel faktörlere bağlı olarak gelişmektedir. Kurbağala...

Derleme2018Acta Aquatica Turcica 24 | 0 Erişime Açık
167490

Genetic diversity and antimicrobial susceptibility of motile aeromonads isolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) farms

ÖZER, Selmin | BULDUKLU, Sevim | TEZCAN, Seda | DÖNMEZ, Erdem | AYDIN, Esin | ASLAN, Gönül | EMEKDAŞ, Gürol

A total of 22 motile Aeromonas strains were detected in 48 (18.53%) of 259 fish and 6 (10.71%) of 56 water samples obtained from seven commercial rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) farms in the province of Mersin, Turkey. These strains were identified by conventional microbiological techniques and by using an ID32GN system. Of these isolates 20 (91.3%) were identified as Aeromonas hydrophila and 2 (8.7%) as Aeromonas sobria. While 8 of the A. hydrophila strains were isolated from water samples, 12 isolates were from fish samples. Whereas A. hydrophila strains were found in all farms, A. sobria was detected in only two farms. Genetic diversity by arbitrarily primed polymerase chain reaction (AP-PCR) and antimicrobial sensitivity tests were carried out on eight A. hydr...

167524

Effects of Grobiotic®-A on growth, whole body composition, and intestinal histology of endangered brown trout (Salmo trutta macrostigma)

ÖZER, Selmin

Brown trout is a very important salmonid species with high economic value and an important aquaculture potential. Due to various reasons, it is in danger of extinction in its natural environment. For this reason, both stocking studies have been carried out in natural environments and aquaculture potential has been investigated. As functional feed additives prebiotics have been reported to have many beneficial effects on growth, survival, immune system, increased absorption in the gut, and improving the general welfare of some fish and crustaceans. The dietary supplementation of the commercial prebiotic Grobiotic®-A (Gb-A) has not been evaluated in Salmo trutta macrostigma. This study was planned a preliminary investigation of Gb-A prebiotic supplementation in brown trout diets. In this st...

Makale2020Marine and Life Sciences 17 | 0 Erişime Açık
167494

Evaluation of Fluorescence in situ Hybridization (FISH) and Polymerase Chain Reaction (PCR) for Identification of Enterococcus spp. in Fish and Water

ÖZER, Selmin | BÖREKÇİ, Gülay | KANIK, Arzu

Three methods for identifying Enterococcus spp. and E. faecalis were compared. Using conventional culture methods, 99 isolates from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum) and water samples were identified as Enterococcus spp. and 86.7% of these were identified as E. faecalis. Using the oligonucleotide probes Eub338, NonEub, Enc145, Efs129, and Str, fluorescence in situ hybridization (FISH) identified 73.7% of the 99 Enterococcus spp. as Enterococcus spp. and 58.6% as E. faecalis. Using polymerase chain reaction (PCR) methods, 88.9% of the 99 samples were identified as Enterococcus spp., 36.4% as E. faecalis, and none as E. faecium. Thus, the consistency between conventional, FISH, and PCR methods was inadequate.

167491

Phenotypic and Molecular Characterisation of Yersinia ruckeri Isolates from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) in Turkey

ÖZER, Selmin

The aim of the study was the phenotypic and molecular characterization of Yersinia (Y.) ruckeri strains, the causative agent of Enteric Redmouth Disease (ERM), by antibiotyping, random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) and sodium dodecylsulphate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) patterns of whole cell proteins. For this aim, a total of 97 Y. ruckeri isolates were analyzed. The isolates were distinguished into ten antibiotypes and six phenotypes according to their resistance properties and whole cell protein profiles, respectively. Also, a glycoprotein band of approximately 25.5 kDa was observed in all Y. ruckeri strains tested. In all strains, six different RAPD types were observed. In conclusion, Y. ruckeri isolated from rainbow trout of fish fa...

167508

Mersin ili Çağlarca köyündeki Gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) kuluçkahanelerinde Flavobacterium spp. varlığı

ÖZER, Selmin

Bu araştırma ile Mersin İli Çağlarca Köyü’ndeki iki farklı Gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss) işletmesinin kuluçkahanelerinde Flavobacterium spp. varlığının aranması hedeflenmiştir. Bu amaçla, Aralık 2006 ve Nisan 2007 tarihleri arasında sperma, ovaryum sıvısı, yumurta, 3 aylık oluncaya kadar yavruların tüm gelişim basamaklarından ve işletmelerde kullanılan sudan örnekler alınmıştır. Yavrular yem almaya başladıktan 30–40 gün sonra II. işletmede görülen salgın sonucunda mortalite % 50 olarak gerçekleşmiştir. Hastalık bulgusu olarak renkte kararma, eksoftalmus, sırt yüzgecinde ve kuyruk yüzgecinde erozyonlar, uyuşukluk, halsizlik, su yüzeyine yakın yüzme ve yem alma oranında azalma gözlemlenmiştir. Otopsi bulgusu olarak solungaçlarda ve karaciğerde anemi ve hemoraji, dalakta büyüme te...

167499

Mersin ilinde yetiştiriciliği yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) streptokokkozis varlığı

ÖZER, Selmin | DÖNMEZ, Erdem

Mersin ilinde faaliyet gösteren yedi Gökkuşağı alabalığı işletmesinde bir yıl süreyle 260 adet farklı büyüklüklerde balık örneği ve 56 adet su örneği Gram pozitif bakteri florası açısından klasik izolasyon ve identifikasyon yöntemleriyle incelenmiştir. İzolatların identifikasyonu ticari ID32Strep hızlı kiti (BioMerieux) ile yapılmıştır. Balık örneklerinin 63’ünde (%24.23) ve su örneklerinin 9’unda (%16.07) 59 adet Gram pozitif, katalaz ve oksidaz negatif kok izole edilmiştir. V. İşletmede yıl boyunca herhangi bir kokkal izolata rastlanmazken, işletmelerin hiçbirinde kış aylarında Gram pozitif, katalaz ve oksidaz negatif kok saptanmamıştır. Gram pozitif, katalaz ve oksidaz negatif kok izolatlar Aerococcus viridans, Enterococcus durans/hirae, Enterococcus faecium-1, Lactococcus garvieae, La...

167498

Mersin’de Tüketime Sunulan Gökkuşağı Alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Motil Aeromonas’ların Araştırılması ve Mezofilik Aerobik Bakteri Sayımı

ÖZER, Selmin

An investigation of motil aeromonads and mesophilic aerobic bacteria count in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) marketed in Mersin. In this study, Rainbow trout, sold at three different outlets in Mersin, were tested for motil Aeromonads, zoonose disease agents. 120 samples were collected and analysed from November 2003 to June 2004. Motil Aeromonads were not isolated in any of the Rainbow trout samples. The 8 month mean values of mesophilic aerobic bacteria count of the skin, muscle, organs and intestine of the fishes were at the 1. outlet respectivly 7,4x105, 4,5x104, 6,9x104 and 1,1x107; at 2. outlet 6,8x104, 5,4x103, 8,3x103 and 4,9x106 and at 3. outlet 1,7x105, 1,3x104, 1,1x104 and 2,9x106 CFU g-1. Bu çalışmada, zoonotik hastalık etkenlerinden Motil Aeromonas’ların Mer...

167500

Mersin ili Çağlarca köyündeki Gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) kuluçkahanelerinin mikrobiyal florası

ÖZER, Selmin

15.12.2006 ve 25.04.2007 tarihleri arasında Mersin İli Çağlarca köyünde bulunan iki Gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) işletmesinden su örnekleri, sperma, ovaryum sıvısı, yumurta, döllenmiş yumurta, gözlenmiş yumurta, keseli yavru ve yemlenen yavrulardan örnekler alındı. Örnekler toplam aerobik bakteri sayısı, Gram negatif bakterilerin izolasyonu ve identifikasyonu yönünden klasik yöntemlerle incelendi. Gram negatif bakterilerin identifikasyonu ID32GN kiti (BioMerieux) ile yapıldı. Su kaynaklarının sıcaklık, çözünmüş oksijen, oksijen doygunluğu ve pH değerleri ölçüldü. I. İşletmeden 36 su örneği ve 24 balık örneği, II. işletmeden 41 su örneği ve 146 adet balık örneği laboratuvara getirildi. İşletmelerde kullanılan suyun fizikokimyasal kriterler ve toplam aerobik bakteri say...

167497

Phenotypic and molecular characterization of Yersinia ruckeri isolates from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) in Turkey

ÖZER, Selmin

The aim of the study was the phenotypic and molecular characterization of Yersinia (Y.) ruckeri strains, the causative agent of Enteric Redmouth Disease (ERM), by antibiotyping, random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) and sodium dodecylsulphate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) patterns of whole cell proteins. For this aim, a total of 97 Y. ruckeri isolates were analyzed. The isolates were distinguished into ten antibiotypes and six phenotypes according to their resistance properties and whole cell protein profiles, respectively. Also, a glycoprotein band of approximately 25.5 kDa was observed in all Y. ruckeri strains tested. In all strains, six different RAPD types were observed. In conclusion, Y. ruckeri isolated from rainbow trout of fish farms...

167495

Molecular identification and determination of some virulence genes of Aeromonas spp. in fish and water from Turkish coastal regions

ÖZER, Selmin

Identification of Aeromonas species is known to be troublesome due to their phenotypic and genotypic heterogeneity. A total of 60 bacterial isolates from water and rainbow trout samples from Turkish coastal regions (Black Sea, Aegean Sea and Mediterranean Sea) were used for 16S rDNA-Restriction Fragment Length Polymorphisms (RFLP) analysis with AluI, MboI, NarI and PstI as restriction enzymes and molecular identification was eventually completed with PCR amplification of the fstA, A. salmonicida specific gene. In addition, the presence of 6 virulence genes (aer, ser, lip, gcat, nuc and laf) in the isolates was investigated using rapid hexaplex-PCR. The frequencies of the identified Aeromonas species were 38.33% for A. sobria, 23.33% for A. hydrophila, 10.0% for A. veronii and 26.67% for ...

167537

Mersin’de yetiştiriciliği yapılan gökkuşağı alabalıkları (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792)’ında saptanan ektoparazit protozoonlar

ÖZER, Selmin | KOYUNCU, Erkin | DÖNMEZ, Erdem | Pınar, ERDOĞAN

Mersin ilinde faaliyet gösteren 7 gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792 işletmesinde 2005 yılında bir yıl süreyle 226 balık paraziter yönden incelenmiştir. İşletmelerde kullanılan suyun sıcaklığı (ºC), çözünmüş oksijen (mg/L) ve pH değerleri ölçülmüştür. Mikroskobik bakı balıkların dış yüzeyi, yüzgeçleri ve solungaç yapraklarından kazıntı alınarak 100X, 250X ve 400X büyütme ile ışık mikroskobunda natif olarak yapılmıştır. İncelenen 226 adet balığın 41’inde (%18,14) 42 adet ektoparazit protozoona rastlanmıştır. 25 (%11,06) adet balıkta Ichtyophythirius multifiliis Fouquet, 1876, 12 (%5,31) balıkta Trichodina spp. Ehrenberg, 1838 ve 5 (%2,21) adet balıkta Chilodonella spp. Strand, 1926 tespit edilmiştir. Bir adet balıkta Trichodina spp. ve Chilodonella spp. görülmüştür. Ba...