Vücut alanımızı paylaştığımız mikroorganizmaların varlığı eskiden beri bilinen bir gerçektir. Ancak yaşam şeklimizdeki değişiklikler ve özellikle de karşılaştığımız yeni moleküler bileşikler, bu mikroorganizmalar üzerinde çeşitli etkilere neden olmaktadır. Son zamanlarda geliştirilen yeni nesil sekanslama teknikleri, bu mikroorganizma topluluklarındaki değişikliklerin oldukça ayrıntılı bir biçimde analiz edilmesine imkan vermektedir. Yapılan son çalışmalar da bize bu mikroorganizmaların topluluklarının insan sağlığı üzerinde tahmin edilenden daha fazla etkiye sahip olduğunu göstermektedir.