Taylan Bozok Taylan Bozok TIP FAKÜLTESİ TEMEL TIP BİLİMLERİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI
Araştırmacının yayınlarını daha detaylı bir şekilde aramak veya filtrelemek için buraya tıklayabilirsiniz.

Epidemiological and molecular characterization of Enterobius vermicularis cases in Mersin, Turkey: An analysis based on mitochondrial DNA cox1 gene sequences

Gülbudak Harun | Tezcan Ülger Seda | Bozok Taylan | Aslan Gönül

Enterobius vermicularis is among the most common intestinal helminths, especially in children. Mitochondrial cox1 gene analyses revealed three genotypes (A, B, C). We aimed to evaluate the epidemiological characteristics and cox1 genotypes of E. vermicularis cases diagnosed at Mersin University Hospital. Between January 2017 and December 2023, 1496 samples were examined using the cellophane tape method, and 75 positives were identified. Epidemiological data were retrospectively analyzed. DNA was isolated from 30 positive samples via the phenol–chloroform method, and nested PCR products of the cox1 gene were sequenced. Phylogenetic analyses were performed using GenBank sequences. In a sample of patients with gastrointestinal signs, the positivity rate for E. vermicularis was 5 % (75/1496). Among the positive cases, 93.3 % were pediatric, with a mean age of 8.7 ± 7.7 years, and the highest prevalence (9 %) was observed in the 5–10 age group. The most commonly reported symptoms included abdominal pain (49.3 %), perianal itching (40 %), and nocturnal drooling (33.3 %). Molecular analysis revealed that all isolates belonged to genotype B, and eight haplotypes were identified. Six haplotypes were novel, while two haplotypes were identical to sequences previously reported from Iran,...

Evaluation of cutaneous leishmaniasis cases in Mersin, Türkiye: Impact of migration and the COVID-19 pandemic

Gülbudak Harun | Bozok Taylan | Tezcan Ülger Seda | İkizoğlu Güliz | Delialioğlu Nuran | Aslan Gönül

Introduction: Cutaneous leishmaniasis (CL) is a significant public health concern in Türkiye, especially in the Southeastern Anatolia and Mediterranean regions. This study evaluated the epidemiological characteristics of CL cases diagnosed at Mersin University Hospital, including the impact of migration and the COVID-19 pandemic. Methodology: The diagnosis of CL was confirmed by microscopic examination of lesion smears. In this study, data from 144 patients diagnosed with CL between January 2011 and December 2022 were evaluated retrospectively. Demographic characteristics of the patients, temporal distribution (by month and year), and lesion features (location, number, and duration) were included. Results: CL was confirmed in 32.9% of patients (144/438). Of the 144 patients, 82 (56.9%) were Turkish citizens and 62 (43.1%) were Syrian refugees. The mean age was 20.7 ± 19.8 (1-78) years. CL was detected more frequently in females (52.1%, 75/144) and in the 0–20-year age group (64.6%, 93/144). The head-neck region was the most affected (53.9%), and the mean lesion duration was 6.8 ± 11.6 months. Most cases were detected in February and March. The number of cases increased with Syrian refugee migration but decreased during the COVID-19 pandemic. Conclusions: Although the fre...

Bloodstream infections caused by carbapenemresistant Klebsiella pneumoniae: analysis of risk factors, treatment responses and mortality

Bozok, Tuğçe Şimşek | Bozok, Taylan | Şahinoğlu, Mustafa Serhat | Kaya, Hamide | Horasan, Şahin Elif | Kaya, Ali

Objective: Bloodstream infections (BSIs) caused by carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) are a serious threat to public health. In this study, it was aimed to evaluate the risk factors, treatment, length of hospitalisation and mortality of patients with BSI caused by CRKP. Methods: Between October 2021 and October 2023, patients aged 18 years and older who were treated for BSI at Mersin University Faculty of Medicine Hospital and had pathogens identified as CRKP or carbapenem-sensitive Klebsiella pneumoniae (CSKP) were retrospectively reviewed and included in the study. Results: Of the 107 patients with BSI included in the study, 66 (61.7%) had CRKP and 41 (38.3%) had CSKP. The risk factors associated with CRKP in BSIs were found to be acute renal failure (p¼0.048), mechanical ventilation (MV) (p¼0.042), post-earthquake period (p¼0.022) and use of carbapenem (p

Investigation of efflux pump genes in isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis isolates

Kaya, Hamide | Ersoy, Leyla | Ülger, Mahmut | Bozok, Taylan | Aslan, Gönül

Background: Tuberculosis (TB) is one of the most important infectious diseases worldwide. Resistance to antituberculosis drugs develops because of genetic mutations that render drug-activating enzymes inactive, changes in cell wall permeability, and increased expression of efflux pump genes and also combination therapy with efflux pump inhibitors may be more effective in drug-resistant TB patients. Aims: To investigate the effect of verapamil (VR) on isonicotinic acid hydrazide (INH) resistance and the expression of 21 efflux pump genes in INH monoresistant MTBC clinical isolates. Study design: In vitro study. Methods: In our mycobacteriology laboratory, 10 INH monoresistant and 10 primary anti-TB drug-susceptible MTBC clinical isolates were selected. Drug susceptibilities for INH and VR were studied by resazurin microtiter plate method and minimum inhibitory concentration (MIC) was determined. Additionally, mRNA gene expressions were investigated by quantitative Real Time Polymerase Chain Reaction for 21 efflux gene regions. Results: While no change was observed in INH MICs of susceptible isolates under VR effect, 6 (60%) of the 10 INH resistant isolates showed a decrease of less than one dilution in INH MIC under VR effect. VR significantly reduced resistance in resistant i...

COVID-19 Hastalarının Alt Solunum Yolu Örneklerinden İzole Edilen Bakteriyel Etkenlerin İdentifikasyonu ve Antibakteriyel Direnç Paternlerinin İncelenmesi

Bozok, Taylan

Amaç: Bu çalışmada amaç, COVID-19 hastalığı nedeni ile yatan hastalarda meydana gelen sekonder bakteriyel enfeksiyon etkenlerini tanımlamak ve bu etkenlerin antibakteriyel direnç durumlarını belirlemektir. Böylece sekonder enfeksiyon düşünülen hastalarda başlanacak ampirik tedavi için öngörü sağlanarak gereksiz antibiyotik kullanımı önlemede katkıda bulunulacaktır. Yöntem: Çalışmamızda, Mart 2020 ve Şubat 2021 tarihleri arasında Niğde Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde COVID-19 nedeni ile Yoğun Bakım Ünitesi (YBÜ)’nde yatan hastalardan gönderilen alt solunum yolu örneklerinden izole edilen toplam 315 adet izolat incelenmiştir. Demografik ve laboratuvar verileri hastane otomasyon sisteminden retrospektif olarak analiz edilmiştir. Bakteriyel izolatların tanımlanması ve antibiyotik duyarlılığı Vitek 2 Compact (Biomerieux, Fransa) cihazı ile yapılmış ve EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) kriterlerine göre değerlendirilmiştir. Bulgular: COVID-19 nedeni ile hastanemizde yatan 5.753 hasta incelenmiş ve bunlardan YBÜ’de bulunan 315’inde (%5.5) sekonder bakteriyel enfeksiyon belirlenmiştir. Pandemi döneminde Gram-negatif bakterilerden en çok sırayla Acinetobacter baumannii (%47.8), Klebsiella pneumoniae (%13.4) ve Pseudomonas aeruginosa (%12.0) üremesi gö...

Prevalence and demographic features of rotavirus, enteric adenovirus and enteric parasite infections in a tertiary hospital: A six-year retrospective cross-sectional study

Bozok, Taylan | Bozok, Tuğçe Şimşek

Amaç: Bu çalışmada ishal ön tanılı hastaların rotavirüs, enterik adenovirüs ve enterik parazit inceleme sonuçlarının demografik verilerle ilişkilerinin analiz edilmesi amaçlandı. Yöntem: Ocak 2014 – Aralık 2019 tarihleri arasında Niğde Eğitim ve Araştırma Hastanesi laboratuvarında taze dışkı örneğinde immünkromatografik yöntemle çalışılmış rotavirüs, adenovirüs antijeni ve ışık mikroskobu altında 40x büyütmede parazit inceleme sonuçları retrospektif olarak değerlendirildi. Test sonuçları yaşa, cinsiyete, uyruğa, mevsimlere, yıllara ve hastaneye başvuru şekline göre ki-kare yöntemi ile analiz edildi. p değeri <0.05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi. Bulgular: İncelenen altı yıllık rotavirüs, adenovirüs ve dışkıda parazit inceleme testlerinin pozitiflik oranları; rotavirüs için %7.7, adenovirüs için %2.3 ve parazit inceleme için %16.8 olarak bulundu. Rotavirüs ve adenovirüs pozitifliği en yüksek 0-2 yaş grubunda (%11.1), parazit görülme oranları ise en yüksek 6-10 yaş grubunda (%23.9) tespit edildi. Rotavirüs pozitifliği kış aylarında, parazit görülme oranları ise yaz aylarında yüksek bulundu (p<0.001). Adenovirüs pozitifliği ise sonbahar ve kış aylarında yüksek oranda tespit edildi (p=0.009). Rotavirüs pozitifliği göçmenlerde daha yüksek oranda tespit edildi (p=0.021...

Comparison of Candida Polymerase Chain Reaction Method and Blood Culture in Patients with High Risk of Candidemia in Intensive Care Unit

Bozok, Tuğçe Şimşek | Bozok, Taylan

Candida species are responsible for 70-90% of invasive fungal infections in the intensive care unit. Early diagnosis and treatment is important in candidemia. Improper diagnosis and treatment increases mortality and morbidity significantly. Because of the late results of blood cultures and low sensitivity of the serological tests when used alone, molecular methods should be investigated in this field. In this study, the results of the Candida real-time polymerase chain reaction (Rt-PCR) test, which was studied from blood culture and whole blood, were compared in patients with high candidemia risk who were followed in the General Surgery Intensive Care and Anesthesiology and Reanimation Unit of Cukurova University Faculty of Medicine. It was aimed to investigate the practical utility of Candida RT-PCR test, which is a rapid diagnosis method in patients with suspected candidemia. In our study, 90 patients with high risk of candidemia according to the criteria determined according to the guidelines were evaluated prospectively. Urine, perineum, axilla, tracheal aspirate culture and two sets of blood cultures were obtained from the patients. Blood sample was also drawn into an ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) tube and stored at -40°C for later Candida Rt-PCR study. In Candida R...

Niğde İlinde Yaş Gruplarına Göre Hepatit A, B ve C Seroprevalansı

Bozok, Tuğçe Şimşek | Bozok, Taylan

Giriş: Viral hepatitler insan sağlığını tehdit eden, morbidite ve mortalitesi yüksek olan önemli bir sağlık sorunudur. Bu çalışmada Niğde ilinde yaş gruplarına ve cinsiyete göre hepatit A, B ve C seroprevalansının araştırılması ve karşılaştırılması amaçlandı. Materyal ve Metod: Çalışmamıza Kasım 2016-Kasım 2019 tarihleri arasında Niğde Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde çeşitli nedenlerle hepatit markerları çalışılan hastalar dahil edildi. Sonuçlar retrospektif olarak analiz edildi. İncelenen hastaların yaş gruplarına ve cinsiyete göre seroprevalans değerleri hesaplandı ve gruplar arası veya cinsiyete göre farklılıkları ki-kare testi yöntemiyle analiz edildi. Bulgular: 2565 hastaya Anti-HAV IgG, 100419 hastaya HBsAg, 98050 hastaya Anti-HCV testi yapılmıştı. Çalışmaya alınan hastalarda Anti-HAV IgG %63.8, HBsAg %4.0, Anti-HCV pozitifliği %1.2 oranında bulundu. Anti-HAV IgG, HBsAg ve Anti-HCV pozitifliği 20 yaş ve üstü hastalarda, 20 yaş altı hastalara göre fazlaydı (p< 0.001). 20 yaş ve üstü hastalarda Anti-HAV IgG, HBsAg, Anti-HCV pozitifliği erkeklerde kadınlara göre daha fazla bulunurken (p< 0.001), 20 yaş altında cinsiyet farkı saptanmadı (p> 0.05). Sonuç: Çalışmamızda saptanan Anti-HAV IgG pozitifliği, Türkiye’de yapılmış diğer çalışmalara göre düşük bulunurken, HBsAg ve Anti-...

Evaluation of rapid antibody test and chest computed tomography results of COVID-19 patients: A retrospective study

Bozok, Taylan | Bozok, Tuğçe Şimşek

The purpose of this study was to evaluate the SARS-CoV-2 immunoglobulin M/immunoglobulin G (IgM/IgG) rapid antibody test results in symptomatic patients with COVID-19 and their chest computed tomography (CT) data. A total of 320 patients admitted to our hospital for different durations due to COVID-19 were included in the study. Serum samples were obtained within 0-7 days from COVID-19 patients confirmed by reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and chest CT scan. According to the SARS-CoV-2 RT-PCR results, the patients included in the study were divided into two groups: PCR positive group (n = 46) and PCR negative group (n = 274). The relationship between chest CT and rapid antibody test results were compared statistically. Of the 320 COVID-19 serum samples, IgM, IgG, and IgM/IgG were detected in 8.4%, 0.3%, and 11.6% within 1 week, respectively. IgG/IgM antibodies were not detected in 79.7% of the patients. In the study, 249 (77.8%) of 320 patients had positive chest CT scans. Four (5.6%) of 71 patients with negative chest CT scans had IgM and two (2.8%) were both IgM/IgG positive. IgM was detected in 23 (9.2%), IgG in one (0.4%), and IgM/IgG in 35 (14%) of chest CT scan positive patients. The rate of CT findings in patients with antibody positivity was found ...

A cross-sectional study of real life data of HCV from Turkey south region

Bozok, Taylan

Introduction: This study investigated demographic characteristics and the prevalence of viremia among anti-HCV-positive patients. Methodology: Hospital records of adult patients with anti-HCV positivity between June 2016 and October 2018 were screened retrospectively. Demographic characteristics, genotype distribution, history of injection drug use (IDU), treatment data of HCV RNA-positive patients were investigated. Results: The rate of anti-HCV seropositivity was 1.7% and 54.5% of these were viremic. 69.5% of the 869 viremic patients were male. The mean age was 62 ± 15 (18-95) years for women and 42 ± 19 (18-90) years for men (p < 0.0001). 42.7% of these patients had IDU history. Regarding age, patients with IDU history accounted for 95% of the 18-29 age group. The most common genotype in patients younger than 40 was genotype 3, and genotype 1b in those older than 40. Only 52% of viremic patients had received DAA therapy. Also, 62.2% of patients aged < 40 and 36% of patients > 40 did not receive treatment (p < 0.0001). The SVR12 rate in patients receiving DAA treatment and follow-up was 100%; SVR24 was 99.5%. Conclusions: A shift in the demographic structure of HCV-infected patients due to the changing trends of the HCV transmission mode was observed in this study. On the other...

Detection and Molecular Analysis of Moxifloxacin MIC Values of Mycobacterium tuberculosis Strains Isolated from Clinical Specimens

Bozok, Taylan

Tüberküloz (TB), Mycobacterium tuberculosis kompleks grubuna ait mikroorganizmaların yol açtığı kronik, granülomatöz ve nekrotizan bir hastalıktır. Dünya Sağlık Örgütü’nün 2018 Global Tüberküloz Raporuna göre 2017 yılında 6.4 milyon yeni TB olgusu bildirilmiştir. Son yıllarda artan ilaç direnç problemi ve kesin tanı konulmasında halen zorluklar olması nedeniyle TB çağımızın büyük sağlık problemleri arasındaki yerini korumaktadır. Klinisyenler tarafından solunum yolu veya üriner sistem enfeksiyonlarında oral formu var olan florokinolon grubu ilaçların yoğun olarak kullanılmasının dirence yol açabileceği ve bunun da tedavi başarısızlıkları ile sonuçlanabileceği belirtilmektedir. Bu çalışmada, klinik örneklerden elde edilen M.tuberculosis izolatlarının moksifloksasin duyarlılıklarının fenotipik yöntemlerle tespit edilmesi, direnç oranlarının belirlenmesi ve fenotipik direnç ile gyrA genindeki mutasyonların ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya akciğer tüberkülozu olan hasta örneklerinden izole edilen M.tuberculosis izolatlarından çok ilaca direnç görülmeyen ardışık 100 izolat ile çok ilaca direnç tespit edilen ardışık olmayan 37 izolat dahil edilmiştir. Bu izolatların Löwenstein-Jensen besiyeri kullanılarak moksifloksasine duyarlılıkları belirlenmiş ve epidemiyolojik öz...

Adana Bölgesindeki Gebelerde 2014-2016 Yıllarında Toxoplasma gondii Seroprevalansı

Bozok, Taylan

Giriş: Toxoplasma gondii, dünyada yaygın şekilde görülen ve insanlarda infeksiyona neden olabilen zoonotik protozoan bir parazittir. Dünya nüfusunun üçte birine yakınının bu etkenle infekte olduğu düşünülmektedir. T. gondii infeksiyonu sağlıklı insanlarda genellikle semptomsuz olmasına rağmen, konjenital infeksiyon gelişimi sonucu fetüste ve bağışıklığı baskılanmış hastalarda ciddi patolojik etkilere neden olabilir. Etkenin bulaşında evde kedi besleme ve çiğ ya da az pişmiş et tüketimi risk faktörlerinin başında gelmektedir. Gebelikte geçirilen infeksiyonda maternal-fetal bulaş riski yaklaşık %30 olarak belirlenmiştir. Gebelerde T. gondii infeksiyonunun bölgesel seroprevalansının belirlenmesi, bu infeksiyonun sosyo-ekonomik maliyetlerini değerlendirmek ve tarama programının tanımlanmasının gerekli olup olmadığına karar vermek için yararlıdır. Materyal ve Metod: Bu çalışmada Ocak 2014-Aralık 2016 tarihleri arasında Adana Kadın Doğum ve Çocuk Hastalıkları Hastanesi polikliniklerine başvuran 15-49 yaş arasındaki gebelerin T. gondii anti-IgM, anti-IgG ve anti-IgG avidite düzeylerinin değerlendirilmesi ve bölgemizdeki seroprevalans oranları hakkında bilgi sahibi olunması amaçlanmıştır. Gebelerden alınan 11.313 serum örneği ELISA tekniği kullanılarak çalışılmıştır. Elde edilen sonuçlar...

Pulmoner Bruselloz Olgu Sunumu

Bozok, Taylan

Bruselloz; ülkemizde endemik olarak görülen, tekrarlayan ateş, eklem ağrısı, halsizlik, iştahsızlık ile seyreden sistemik bir hastalıktır. Solunum sistemi tutulumunda en sık görülen semptom %10-33 ile non prodüktif öksürüktür. Olgumuz, 76 yaşında, erkek hasta kırsal bölgede çiftçilik ile uğraşıyor. On beş gündür devam eden kuru öksürük, üşüme-titreme ile yükselen ateş ve uykuya eğilim şikayetleri ile enfeksiyon hastalıkları servisine yatışı yapıldı. Özgeçmişinde taze peynir tüketimi mevcuttu. Hastaya ampirik sefrtriakson 2x2 gr ve klindamisin 4x600 mg IV başlandı. Brusella agglutinasyonu 1/160 titrede pozitif olarak saptandı. Doksisiklin 2x100 mg ve rifampisin 2x300 mg başlandı. Toraks bilgisayarlı tomografisinde (BT) pnömoni, solda minimal plevral efüzyon izlendi. Pnömoni etkenleri serolojik olarak dışlandı. Bruselloz tedavisinin 5. gününde hastanın ateşi düştü, genel durumu düzeldi ve akciğer dinleme bulgularında düzelme görüldü. Kan kültüründe Brucella melitensis üremesi oldu. Tedavisi 8 haftaya tamamlanan hastada klinik ve radyolojik olarak düzelme görüldü. Ülkemizde endemik olarak görülen brusellozun nadir görülen pulmoner tutulumu, pnömoni ile başvuran hastalarda ayırıcı tanıda akılda tutulmalıdır.

Normal Mikrobiyal Floranın İnsan Sağlığı Üzerine Etkisi ve İnsan Mikrobiyom Projesi

Bozok, Taylan | Bozok, Tuğçe Şimşek

Vücut alanımızı paylaştığımız mikroorganizmaların varlığı eskiden beri bilinen bir gerçektir. Ancak yaşam şeklimizdeki değişiklikler ve özellikle de karşılaştığımız yeni moleküler bileşikler, bu mikroorganizmalar üzerinde çeşitli etkilere neden olmaktadır. Son zamanlarda geliştirilen yeni nesil sekanslama teknikleri, bu mikroorganizma topluluklarındaki değişikliklerin oldukça ayrıntılı bir biçimde analiz edilmesine imkan vermektedir. Yapılan son çalışmalar da bize bu mikroorganizmaların topluluklarının insan sağlığı üzerinde tahmin edilenden daha fazla etkiye sahip olduğunu göstermektedir.