-
DergiPark2
-
Elsevier2
-
Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti2
-
Akademisyen1
-
Archives Medical Review Journal1
-
Bilimsel Tıp Yayınevi1
-
Brieflands STM Publisher1
-
Flora the Journal of Infectious Diseases and Clinical Microbiology1
-
Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi1
-
Journal of Medical Virology1
Prevalence and demographic features of rotavirus, enteric adenovirus and enteric parasite infections in a tertiary hospital: A six-year retrospective cross-sectional study
Bozok, Taylan | Bozok, Tuğçe Şimşek
Amaç: Bu çalışmada ishal ön tanılı hastaların rotavirüs, enterik adenovirüs ve enterik parazit inceleme sonuçlarının demografik verilerle ilişkilerinin analiz edilmesi amaçlandı. Yöntem: Ocak 2014 – Aralık 2019 tarihleri arasında Niğde Eğitim ve Araştırma Hastanesi laboratuvarında taze dışkı örneğinde immünkromatografik yöntemle çalışılmış rotavirüs, adenovirüs antijeni ve ışık mikroskobu altında 40x büyütmede parazit inceleme sonuçları retrospektif olarak değerlendirildi. Test sonuçları yaşa, cinsiyete, uyruğa, mevsimlere, yıllara ve hastaneye başvuru şekline göre ki-kare yöntemi ile analiz edildi. p değeri <0.05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi. Bulgular: İncelenen altı yıllık rotavirüs, adenovirüs ve dışkıda parazit inceleme testlerinin pozitiflik oranları; rotavirüs için %7...
Comparison of Candida Polymerase Chain Reaction Method and Blood Culture in Patients with High Risk of Candidemia in Intensive Care Unit
Bozok, Tuğçe Şimşek | Bozok, Taylan
Candida species are responsible for 70-90% of invasive fungal infections in the intensive care unit. Early diagnosis and treatment is important in candidemia. Improper diagnosis and treatment increases mortality and morbidity significantly. Because of the late results of blood cultures and low sensitivity of the serological tests when used alone, molecular methods should be investigated in this field. In this study, the results of the Candida real-time polymerase chain reaction (Rt-PCR) test, which was studied from blood culture and whole blood, were compared in patients with high candidemia risk who were followed in the General Surgery Intensive Care and Anesthesiology and Reanimation Unit of Cukurova University Faculty of Medicine. It was aimed to investigate the practical utility of Can...
Alpha Human Papillomavirus Types and Genotype Distribution in Psoriasis Patients: A Cross-Sectional Regional Study in Turkey.
Leyla Ersoy | Seda Tezcan Ülger | Ayça Cordan Yazıcı | Gönül Aslan
Background: Human papillomaviruses (HPVs) are members of the P apillomaviridae family, characterized by circular, double- stranded DNA. T hey exhibit strict tropism, infecting either mucosa or skin. T he role of HPV in the etiology of psoriasis remains unclear. Objectives: T he aim of this study was to determine the presence of alpha human papillomavirus in the skin scrapings of patients with psoriasis and its genotype distributions. Methods: T he study employed a cross-sectional design and included 53 psoriasis patients and 47 healthy controls from December 2020 to May 2021. After DNA isolation from skin scrapings, the L1 gene region of HPV was amplified using MY09/11 and GP5 +/6 + consensus primer sequences. T he HPV genotypes were determined through direct DNA sequence analysis of polym...
Hastane kaynaklı ishallerde Clostridioides (Clostridium) difficile araştırılması
Öztürk, Candan | Ülger, Seda Tezcan | Kaya, Hamide | Aslan Tek, Sebahat
Amaç: Clostridioides difficile enfeksiyonu, sağlık hizmeti ile ilişkili bir enfeksiyon olup özellikle hastanede yatan hastalar için önemli mortalite ve morbidite kaynağıdır. Çalışmamızda; hastane kaynaklı ishallerde C. difficile insidansını belirlemek için yatan hastaların gaita örneklerinde C. difficile izolasyonu ve toksin varlığının araştırılması amaçlanmıştır. Yöntem: Çalışmaya, Ekim 2020-Temmuz 2021 tarihleri arasında Mersin Üniversitesi Hastanesi’nde çeşitli servislere yatırılan, en az iki gün boyunca günde üçten fazla gevşek veya sulu dışkılama yapan, iki yaş üzerinde 85 hasta dahil edilmiştir. Sızdırmaz kaplarda toplanan gaita örneklerinde, 24-48 saat içinde ‘Epilisa Fecal C. difficile Toksin A/B ELISA kiti (Epitope Diagnostics, Inc. ABD) kullanılarak C. difficile toksin A/B va...
Pulmoner Bruselloz Olgu Sunumu
Bozok, Taylan
Bruselloz; ülkemizde endemik olarak görülen, tekrarlayan ateş, eklem ağrısı, halsizlik, iştahsızlık ile seyreden sistemik bir hastalıktır. Solunum sistemi tutulumunda en sık görülen semptom %10-33 ile non prodüktif öksürüktür. Olgumuz, 76 yaşında, erkek hasta kırsal bölgede çiftçilik ile uğraşıyor. On beş gündür devam eden kuru öksürük, üşüme-titreme ile yükselen ateş ve uykuya eğilim şikayetleri ile enfeksiyon hastalıkları servisine yatışı yapıldı. Özgeçmişinde taze peynir tüketimi mevcuttu. Hastaya ampirik sefrtriakson 2x2 gr ve klindamisin 4x600 mg IV başlandı. Brusella agglutinasyonu 1/160 titrede pozitif olarak saptandı. Doksisiklin 2x100 mg ve rifampisin 2x300 mg başlandı. Toraks bilgisayarlı tomografisinde (BT) pnömoni, solda minimal plevral efüzyon izlendi. Pnömoni etkenleri serolo...
Tüberkülozda İlaç Direnci ve Dirençli Tüberkülozda Yeni Alternatifler: Eflüks Pompa İnhibitörleri
Kaya, Hamide
Tüberküloz (TB) insanlar için tüm dünyada ciddi bir halk sağlığı problemi olmaya devam etmektedir. Tedavi sürecinde kullanılan ilaç sayısının fazla olması ve tedavinin uzun süreli olması hastaların tedaviye uyumunu zorlaştırmaktadır. Tedavi uyumsuzluklarının da bir sonucu olarak ilaç direnci hızla yayılmaktadır. Hem tedavi sürecini kısaltacak hem de ilaç direncini azaltacak yeni protokollerin geliştirilmesine ihtiyaç vardır. Bu sebeple yapılan birçok çalışmada anti-TB ilaç direncinin sebeplerinden birinin de eflüks pompa sistemleri olduğu gözlenmiştir. Direncin azaltılması için bu eflüks pompalarının inhibisyonu için kullanılacak moleküller tedavi protokollerinde kullanılmaya başlanmış ve olumlu sonuçlar alınmıştır. İn vitro çalışmalarda verapamilin ve diğer eflüks pompa inhibit...
Antibiotic susceptibilities and microorganisms isolated from blood cultures of inpatients in a secondary state hospital in Türkiye
Kaya, Hamide | Öztürk, Candan
Purpose: The aim of this study was to evaluate the bacterial species distribution and antibiotic susceptibility in blood cultures obtained from patients in a secondary care center in Mersin, Türkiye. Materials and Methods: Blood culture specimens of inpatients sent to the microbiology laboratory between January 2022 and December 2023 were retrospectively analyzed to determine the etiologic agents of bloodstream infections and to evaluate their antimicrobial susceptibility. Samples were processed using the BD Bactec FX40 automated blood culture system (BD, USA), which allows continuous monitoring and rapid detection of microbial growth. Typing of causative agents in positive cultures and antimicrobial susceptibility testing were performed using conventional methods and the Vitek2 Compact ...
Effects of Sequential Antimicrobial Phases on Root Canal Microbiome Dynamics in Two-Visit Treatment of Primary Apical Periodontitis: A Longitudinal Experimental Study.
Seda Tezcan Ülger | Gönül Aslan
Abstract: Background: Effective management of primary apical periodontitis depends on understand- ing the dynamic interactions within the root canal microbiome. This study aimed to investigate the effect of sequential antimicrobial phases on the root canal microbiome during a two-visit treatment approach, with a focus on calcium hydroxide medication. Methods: Samples were collected from three teeth across four treatment phases: initial infection (S1), after chemomechanical preparation (S2), after intracanal medication (S3), and after a final flush (S4). DNA was extracted, and the V3–V4 regions of the 16S rRNA gene were sequenced using Illumina MiSeq. Sequencing data were analyzed with QIIME 2, and differentially abundant taxa were identified using linear discriminant analysis effect size (...
Yemler Bilgisi Yem Teknolojisi ve Balık Besleme
Bilgüven, Murat
Her havuz alanında ya da yetiştirme biriminden elde edilen balık ve dolayısıyla balık yetiştiriciliğinin kârlılığı, büyük ölçüde kullanılan yemin miktarına bağlıdır. Su ürünleri sistemi ne kadar yoğun olursa yemlemenin önemi o kadar fazla olur ve toplam üretim maliyetinde yem maliyetinin payı da o kadar artar. Bilindiği üzere alabalık başta olmak üzere bazı balıkların yetiştiriciliği için akarsu sistemli tesisler kullanılmakta yada sıcaklığın, su bileşiminin ve akıntının dolayısıyla oksijen yoğunluğunun daha iyi olduğu tatlı su ve kıyılarda ise yüzer ağ kafeslerde yetiştiricilik yapılmaktadır. Su ürünleri yetiştiriciliğinin ileri durumda olduğu ülkelerde entansif yetiştiricilik uygulanmakta ve yetiştirme alanlarında birim hacimde maksimum ürün yetiştirilmeye çalışılmaktadır. Bu tür yetişti...
Niğde İlinde Yaş Gruplarına Göre Hepatit A, B ve C Seroprevalansı
Bozok, Tuğçe Şimşek | Bozok, Taylan
Giriş: Viral hepatitler insan sağlığını tehdit eden, morbidite ve mortalitesi yüksek olan önemli bir sağlık sorunudur. Bu çalışmada Niğde ilinde yaş gruplarına ve cinsiyete göre hepatit A, B ve C seroprevalansının araştırılması ve karşılaştırılması amaçlandı. Materyal ve Metod: Çalışmamıza Kasım 2016-Kasım 2019 tarihleri arasında Niğde Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde çeşitli nedenlerle hepatit markerları çalışılan hastalar dahil edildi. Sonuçlar retrospektif olarak analiz edildi. İncelenen hastaların yaş gruplarına ve cinsiyete göre seroprevalans değerleri hesaplandı ve gruplar arası veya cinsiyete göre farklılıkları ki-kare testi yöntemiyle analiz edildi. Bulgular: 2565 hastaya Anti-HAV IgG, 100419 hastaya HBsAg, 98050 hastaya Anti-HCV testi yapılmıştı. Çalışmaya alınan hastalarda Anti-...
Normal Mikrobiyal Floranın İnsan Sağlığı Üzerine Etkisi ve İnsan Mikrobiyom Projesi
Bozok, Taylan | Bozok, Tuğçe Şimşek
Vücut alanımızı paylaştığımız mikroorganizmaların varlığı eskiden beri bilinen bir gerçektir. Ancak yaşam şeklimizdeki değişiklikler ve özellikle de karşılaştığımız yeni moleküler bileşikler, bu mikroorganizmalar üzerinde çeşitli etkilere neden olmaktadır. Son zamanlarda geliştirilen yeni nesil sekanslama teknikleri, bu mikroorganizma topluluklarındaki değişikliklerin oldukça ayrıntılı bir biçimde analiz edilmesine imkan vermektedir. Yapılan son çalışmalar da bize bu mikroorganizmaların topluluklarının insan sağlığı üzerinde tahmin edilenden daha fazla etkiye sahip olduğunu göstermektedir.
Evaluation of rapid antibody test and chest computed tomography results of COVID-19 patients: A retrospective study
Bozok, Taylan | Bozok, Tuğçe Şimşek
The purpose of this study was to evaluate the SARS-CoV-2 immunoglobulin M/immunoglobulin G (IgM/IgG) rapid antibody test results in symptomatic patients with COVID-19 and their chest computed tomography (CT) data. A total of 320 patients admitted to our hospital for different durations due to COVID-19 were included in the study. Serum samples were obtained within 0-7 days from COVID-19 patients confirmed by reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and chest CT scan. According to the SARS-CoV-2 RT-PCR results, the patients included in the study were divided into two groups: PCR positive group (n = 46) and PCR negative group (n = 274). The relationship between chest CT and rapid antibody test results were compared statistically. Of the 320 COVID-19 serum samples, IgM, IgG, an...
Adana Bölgesindeki Gebelerde 2014-2016 Yıllarında Toxoplasma gondii Seroprevalansı
Bozok, Taylan
Giriş: Toxoplasma gondii, dünyada yaygın şekilde görülen ve insanlarda infeksiyona neden olabilen zoonotik protozoan bir parazittir. Dünya nüfusunun üçte birine yakınının bu etkenle infekte olduğu düşünülmektedir. T. gondii infeksiyonu sağlıklı insanlarda genellikle semptomsuz olmasına rağmen, konjenital infeksiyon gelişimi sonucu fetüste ve bağışıklığı baskılanmış hastalarda ciddi patolojik etkilere neden olabilir. Etkenin bulaşında evde kedi besleme ve çiğ ya da az pişmiş et tüketimi risk faktörlerinin başında gelmektedir. Gebelikte geçirilen infeksiyonda maternal-fetal bulaş riski yaklaşık %30 olarak belirlenmiştir. Gebelerde T. gondii infeksiyonunun bölgesel seroprevalansının belirlenmesi, bu infeksiyonun sosyo-ekonomik maliyetlerini değerlendirmek ve tarama programının tanımlanmasının...
A cross-sectional study of real life data of HCV from Turkey south region
Bozok, Taylan
Introduction: This study investigated demographic characteristics and the prevalence of viremia among anti-HCV-positive patients. Methodology: Hospital records of adult patients with anti-HCV positivity between June 2016 and October 2018 were screened retrospectively. Demographic characteristics, genotype distribution, history of injection drug use (IDU), treatment data of HCV RNA-positive patients were investigated. Results: The rate of anti-HCV seropositivity was 1.7% and 54.5% of these were viremic. 69.5% of the 869 viremic patients were male. The mean age was 62 ± 15 (18-95) years for women and 42 ± 19 (18-90) years for men (p < 0.0001). 42.7% of these patients had IDU history. Regarding age, patients with IDU history accounted for 95% of the 18-29 age group. The most common genotype i...
Investigation of the relationship between periodontal and systemic inflammation in children with Sickle Cell Disease: A case- control study
Öztürk, Candan | Aslan Tek, Sebahat | Taşdelen, Bahar | Ünal, Selma
Periodontal diseases are chronic inflammatory diseases and tissue destruction increases with oxidative stress in periodontal tissues. Periodontal diseases are associated with systemic diseases such as diabetes, cardio-vascular diseases and rheumatoid arthritis by means of systemic inflammation. Sickle cell disease (SCD) is a chronic inflammatory disease in which vaso-occlusive crisis and endothelial dysfunction are present. It is not known whether the chronic systemic inflammation seen in SCD affect periodontal tissues. The aim of this study was to investigate the relationship between periodontal and systemic inflammation in children with SCD. Forty-three children with SCD and 43 healthy children were included in the study. Physical, dental and periodontal statuses were examined, blood and...
Role of antioxidant defense system and biochemical adaptation on stress tolerance of high mountain and steppe plants
Keleş, Yüksel
Eleven species were collected from Northwest Anatolian mountains (1500–2000 m) and 18 species were collected from the Central Anatolian steppes (850–1000 m) in June 1998 and 1999. In all the species investigated, the water and dry matter percentages and solute contents were measured. The chlorophyll, b-carotene, ascorbate and a-tocopherol contents and catalase (CAT), superoxide dismutase (SOD) andglutathione reductase (GR)enzymeactivities oftheplants werealsodetermined.Thesteppeplantshadlowerwatercontentcomparedwith alpine plants. The chlorophyll contents of the plants investigated did not change with altitude. However, the carotenoid/chlorophyll ratio of alpine plants was found to be significantly higher. The antioxidant/chlorophyll ratio of the trees and shrubs was higher than that of he...